Mientras que la piedra es diferente de la de todos los otros templos tal vez porque estaba cubierto de arena durante tanto tiempo, la característica más destacada del templo de Kom Ombo es inusual, aunque plan único, el suelo, el resultado de la unificación de los dos templos adyacentes, cada uno dedicado a una divinidad distinta: la cabeza de cocodrilo Sobek, dios de la fertilidad y creador del mundo, y Haroeris o la antigua Horus con cabeza de halcón, el godThis guerra solar fue por qué el templo fue llamado tanto "Casa de los cocodrilos" y "Castillo del Halcón". Una línea imaginaria que divide el templo longitudinalmente en dos partes, cada una con su entrada, salas hipóstilas, capillas, etc La parte derecha del templo fue consagrado a Sobek, a la izquierda para Haroeris, cuyo disco alado que protege de todo mal es representado por todos los portales de entrada. Este templo, también, fue obra de los Ptolomeos que lo construyó en el sitio de un santuario mucho más antigua y más pequeña de la que poco queda. Todo lo que queda de la torre gran entrada es la parte de la mano derecha, donde el emperador romano Domiciano se puede ver con varios dioses rendir homenaje a la tríada de Sobek, Hathor y Jonsu, junto con un largo texto de 52 líneas de jeroglíficos